Zajišťují komplexní vodohospodářskou správu povodí – ochranu a péči o povrchové a podzemní vody, provoz a údržbu vodohospodářských a hydroenergetických zařízení, protipovodňovou ochranu a zabezpečení odběrů vody. Poskytují inženýrské služby, provozní a laboratorní činnosti zaměřené na udržení jakosti vody a efektivní hospodaření s vodními zdroji.