Poskytují administraci a vyplácení zemědělských a rybářských dotací, vedení Jednotné žádosti a řízení programů rozvoje venkova a národních podpor. Zajišťují implementaci EU fondů, tržní informační systém, evidence příjemců dotací a kontrolu plnění podmínek podpory. Specializují se na podporu zemědělských podniků, venkova a udržitelného zemědělství.