Jako ústřední orgán státní správy zajišťují vnitřní bezpečnost a veřejný pořádek, metodicky řídí Policii ČR a Hasičský záchranný sbor. Dohlížejí na agendu občanských dokladů, registrů obyvatel a migraci, povolování pobytu cizinců, správu státních hranic a organizaci voleb. Zajišťují krizovou připravenost a koordinaci integrovaného záchranného systému.